El proyecto Fly.exe presenta un simulador de cerebro de Drosophila que ejecuta el conectoma central de un macho de Drosophila, compuesto por 165.122 neuronas y 25.563.197 aristas, dentro de un cuerpo físico de mosca en un entorno de MuJoCo. La implementación utiliza una única GPU para gestionar un grafo completo en un bucle cerrado, sin ser una copia recuperada ni un gemelo digital biológico completo, sino una demostración técnica específica.
El sistema simula doce cuerpos de NeuroMechFly dispersos en un disco de 30 mm, cada uno ejecutando una copia del grafo neuronal cada 15 ms. La visión es analítica y no óptica: los codificadores reciben la posición exacta y el radio de los objetos para calcular el ángulo y el tamaño, eliminando píxeles, ray casting o texturas. El movimiento está controlado por dos tasas de población descendentes que superan un umbral, mientras que el contacto con objetos se resuelve mediante el solver de MuJoCo, no por reglas de comportamiento.
La demostración valida la maquinaria del simulador mediante un control con la misma semilla que muestra que, en ausencia de estímulo, ninguna mosca se mueve, mientras que con el estímulo, todas las doce moscas alcanzan objetos de comida. Se destacan limitaciones claras: no hay comportamiento social, forraje ni visión óptica real, ya que los cuerpos pasan entre sí y el codificador lee coordenadas exactas. El proyecto sitúa la demostración en la categoría V0 Structural, validando la infraestructura técnica pero sin probar hipótesis biológicas registradas ni contratos de aceptación para el comportamiento de enjambre.