RESONANCE es un motor de simulación de código abierto (licencia AGPL-3.0) construido con Rust y Bevy ECS que busca modelar la emergencia de la vida, la evolución y estrategias terapéuticas a partir de un conjunto reducido de principios fundamentales. No es una herramienta clínica ni un pipeline de descubrimiento de fármacos, sino un simulador para explorar cómo podrían surgir sistemas complejos a partir de reglas simples.
En esencia, RESONANCE define las leyes de la física (a través de 8 axiomas y 4 constantes fundamentales) y permite observar cómo la vida emerge de ellas. La simulación se organiza en una jerarquía biológica de 10 niveles, desde campos de energía hasta la emergencia de comportamientos sociales. Un aspecto clave es la capacidad de diseñar estrategias terapéuticas 'desde cero', es decir, modelando los procesos biológicos subyacentes en lugar de depender de enfoques empíricos tradicionales. Esto se logra, por ejemplo, inhibiendo rutas metabólicas específicas sin matar células, o implementando un controlador de terapia adaptativa que perfila el tumor y ajusta la dosis y frecuencia del tratamiento para estabilizar el crecimiento a cero.
El motor está 'calibrado clínicamente', lo que significa que los resultados de la simulación se expresan en unidades reales (nM, días, recuento de células) y se comparan con datos publicados de casos clínicos reales, como el tratamiento de la leucemia mieloide crónica (CML) con imatinib, cáncer de próstata con abiraterone y cáncer de pulmón de células no pequeñas (NSCLC) con erlotinib. Además, se ha utilizado para simular casos específicos, como una vacuna personalizada de ARNm contra el cáncer para un perro, validando patrones de respuesta observados en la vida real.
La arquitectura de RESONANCE es notable por su diseño determinista y reproducible, con más de 3.095 pruebas automatizadas que garantizan la consistencia de los resultados. Las constantes fundamentales y los umbrales derivados se calculan algebraicamente, evitando valores codificados directamente en el código. El proyecto es altamente modular, con una estructura de capas ECS (Entity Component System) y un conjunto de ejecutables para diferentes casos de uso, desde la simulación básica hasta la validación de estrategias terapéuticas. Es importante destacar que, aunque calibrado con datos clínicos, RESONANCE no es una herramienta de diagnóstico ni un sustituto para la atención médica profesional, y los resultados son simulaciones, no predicciones garantizadas de resultados en pacientes reales.