Un creciente problema en el desarrollo de software, denominado "deuda cognitiva", está surgiendo a raíz de la rápida adopción de la inteligencia artificial generativa y agente. La deuda cognitiva se define como la brecha entre la estructura evolutiva de un sistema y la comprensión compartida del equipo sobre cómo y por qué funciona y puede modificarse. Expertos como Simon Willison y Martin Fowler señalan que los desarrolladores se sienten cada vez más perdidos en sus propios proyectos, perdiendo la conexión entre las decisiones y el código, lo que afecta la confianza, la eficiencia en las revisiones y la incorporación de nuevos miembros.
Esta deuda no se limita al código (deuda técnica), sino que reside en las personas, manifestándose en fatiga, estrés y dificultades para mantener una visión coherente del sistema. Al igual que la deuda técnica, la deuda cognitiva debe ser "repaid" a través de la documentación, pruebas, conversaciones y, cada vez más, herramientas de IA. Si bien las buenas prácticas de ingeniería deberían mitigar este problema, la presión por la velocidad y los incentivos actuales favorecen la acumulación de deuda cognitiva. Equipos de alto rendimiento deberán adaptar sus prácticas y herramientas para externalizar la intención y mantener la comprensión compartida, ya que esta podría convertirse en el cuello de botella para el rendimiento.