Un empleado de Epic Games confirmó en el Discord comunitario de la tienda que el launcher del Epic Games Store contará con una versión nativa para Linux, aunque sin fecha prevista. A la pregunta de un usuario sobre si una compilación nativa estaba en la hoja de ruta, el representante respondió con un emoji "Soon" y una matización: la versión preliminar del nuevo cliente, en la que Epic trabaja para una reescritura integral, aún no contempla Linux. "Como es lógico, tenemos que hacer algo más que simplemente disponer de un build del launcher que funcione de forma nativa en Linux", explicó el empleado, sin detallar qué falta. El soporte para Linux no figura en la roadmap que Epic presentó en junio en el Unreal Fest.
Hasta ahora, el cliente del Epic Games Store solo está disponible para Windows y macOS. Quienes quieran gestionar su biblioteca de Epic en sistemas Linux como SteamOS de Valve recurren a software de terceros, como el Heroic Games Launcher, un programa de código abierto que integra la biblioteca de Epic mediante la herramienta de línea de comandos Legendary y ejecuta los juegos de Windows a través de Proton o Wine. Un cliente nativo eliminaría esa capa intermedia. GOG también trabaja en una versión Linux de su launcher, y varias distribuciones se han unido en el Open Gaming Collective para mantener conjuntamente parches del kernel y paquetes de gaming.
Un cliente nativo para la tienda no implica que Fortnite funcione en Linux: el juego no se ejecuta allí porque Epic no habilita la compatibilidad con Linux de su propio sistema antitrampas para el título multijugador.